60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6501 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  100 
 
 		 448 aa  869    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0736  polysaccharide biosynthesis protein  30.43 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  22.43 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  28.73 
 
 		 583 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  30.16 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  29.76 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 482 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  32.77 
 
 		 504 aa  56.6  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  28.45 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 471 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  30.36 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0601  putative membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  32.42 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 466 aa  50.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  30.53 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 475 aa  50.1  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  30 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4438  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 467 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 		 478 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 500 aa  46.6  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 476 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 		 476 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  28.75 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  30.88 
 
 		 536 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  30.13 
 
 		 488 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20.05 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  30.12 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 526 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  28.22 
 
 		 529 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 490 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  24.02 
 
 		 464 aa  43.5  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  20.56 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 547 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 399 aa  43.5  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0306  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>