44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2015 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 466 aa  932    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 		 458 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05840  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  27.69 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.597063  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4438  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0736  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  23.04 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  26.54 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 435 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.34 
 
 		 493 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 494 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 488 aa  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  22.95 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1812  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 482 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  23.2 
 
 		 467 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 484 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  20.89 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2946  hypothetical protein  27.15 
 
 		 359 aa  47  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1723  hypothetical protein  20.94 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.402773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 478 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 500 aa  44.3  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 444 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 444 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 492 aa  43.1  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 446 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0119  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000173585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>