20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2946 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2946  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  694    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 
444 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  27.44 
 
 
458 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  31.55 
 
 
444 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
899 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 
433 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  31.76 
 
 
434 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 
466 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
427 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  29.75 
 
 
493 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
433 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  30.58 
 
 
493 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05840  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  28.64 
 
 
432 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.597063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  26.26 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  27.5 
 
 
433 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
507 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 
426 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  30.24 
 
 
430 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 
484 aa  42.7  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>