22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0406 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 458 aa  868    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05840  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  34.19 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.597063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.76 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  30 
 
 		 448 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 		 433 aa  47  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 		 463 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  21.04 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  27.03 
 
 		 485 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  25.29 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  24.71 
 
 		 459 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  25 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  24.71 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  25 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  24.71 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.71 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  24.71 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>