81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2455 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 434 aa  853    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 		 463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  26.26 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  30.27 
 
 		 427 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 482 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  28.5 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 583 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0736  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0601  putative membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.64 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  25.49 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  33.52 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  24.22 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 547 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2014  O-antigen and teichoic acid-like export protein  26.83 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601988  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2777  O-antigen transporter  23.18 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.273029 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 512 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  28.07 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  29.82 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  28.43 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21.49 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  23.7 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 482 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  25.15 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 514 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 475 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 476 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.78 
 
 		 488 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2124  hypothetical protein  27.37 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.553505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  26.8 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  28.42 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 471 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.49 
 
 		 490 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  20.33 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  23.63 
 
 		 525 aa  43.9  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 449 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 483 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 483 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2946  hypothetical protein  28.8 
 
 		 359 aa  43.1  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 475 aa  43.1  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>