18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2185 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  846    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 
463 aa  79.7  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  20.79 
 
 
482 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  22.12 
 
 
439 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
449 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 
427 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 
433 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
504 aa  53.9  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
583 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
482 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
546 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 
477 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 
471 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  29.32 
 
 
482 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 
444 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 
448 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  23.68 
 
 
506 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>