105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2285 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 449 aa  901    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  32.65 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  31.48 
 
 		 426 aa  213  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  30.4 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  30.95 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  29.93 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  30.46 
 
 		 441 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 		 436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  29.67 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  29.4 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  30.1 
 
 		 427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 477 aa  86.7  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1343  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2268  polysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199754 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0919  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.16 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.3 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3779  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3702  polysaccharide exporter, PST family  22.61 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0741  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.28 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1488  hypothetical protein  21.99 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0185846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3084  hypothetical protein  21.7 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0782  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2192  hypothetical protein  21.7 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0715  hypothetical protein  21.7 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2549  hypothetical protein  21.7 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3121  hypothetical protein  21.7 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2065  hypothetical protein  21.7 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0771  membrane protein  22.22 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  23.75 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3144  hypothetical protein  21.7 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  25.31 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2720  polysaccharide biosynthesis protein  24.6 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.88 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3989  hypothetical protein  21.8 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  23.28 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  18.4 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2498  polysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0413  membrane protein  21.93 
 
 		 418 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0892  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 418 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  19.8 
 
 		 486 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 486 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0862  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  30.36 
 
 		 448 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  23.78 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  25.06 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 483 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  24.59 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  29.9 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.42 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  18.45 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 		 542 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 500 aa  47  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  23.27 
 
 		 471 aa  46.6  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2021  polysaccharide biosynthesis protein  20.47 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  21.92 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  24.1 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 		 475 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  20.73 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 		 506 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  53.19 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  22.76 
 
 		 464 aa  43.9  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>