60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2047 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
504 aa  969    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  48.59 
 
 
547 aa  445  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  46.43 
 
 
546 aa  433  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  46.94 
 
 
583 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  49.36 
 
 
477 aa  343  5e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
512 aa  85.9  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  37.09 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  25.18 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 
475 aa  66.6  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 
453 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  29.76 
 
 
433 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 
488 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
423 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 
459 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 
489 aa  61.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 
427 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
519 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 
444 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 
413 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.75 
 
 
517 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  28.76 
 
 
463 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 
499 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
444 aa  53.9  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 
506 aa  53.5  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 
490 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.8 
 
 
488 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 
480 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 
484 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  30.46 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  19.18 
 
 
500 aa  52  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 
483 aa  50.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 
495 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
418 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
418 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 
500 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 
478 aa  50.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  29.54 
 
 
490 aa  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 
486 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  25.41 
 
 
431 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
426 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
486 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
470 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.55 
 
 
490 aa  47.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 
479 aa  47.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  31.29 
 
 
467 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 
482 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  29.35 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 
504 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 
477 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  29.81 
 
 
474 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 
492 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
446 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  30.59 
 
 
492 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
478 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
458 aa  43.9  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>