82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1846 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
433 aa  852    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
463 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  23.65 
 
 
439 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 
434 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 
427 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 
423 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  25 
 
 
433 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
482 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
477 aa  67.4  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 
449 aa  67  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  29.76 
 
 
504 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  27 
 
 
448 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2014  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.86 
 
 
439 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601988  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
546 aa  61.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 
426 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
547 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2777  O-antigen transporter  29.09 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.273029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 
451 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  24.22 
 
 
517 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  31.41 
 
 
478 aa  56.6  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0736  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 
439 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 
440 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  28.3 
 
 
475 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 
583 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 
477 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  18.91 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 
440 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 
487 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  23.97 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  22.13 
 
 
476 aa  51.2  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  19.75 
 
 
478 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 
423 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 
499 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  22.31 
 
 
431 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 
482 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  21.14 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.93 
 
 
461 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.88 
 
 
490 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 
436 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 
458 aa  47  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
503 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
424 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
486 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  25.15 
 
 
506 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  22.41 
 
 
490 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  23.42 
 
 
523 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 
444 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 
511 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 
489 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
484 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  27.1 
 
 
519 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  27.1 
 
 
519 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  27.1 
 
 
519 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0601  putative membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  25.79 
 
 
424 aa  43.5  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 
539 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  27.1 
 
 
519 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  27.1 
 
 
519 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 
490 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.41 
 
 
455 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  26.28 
 
 
473 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  27.18 
 
 
519 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.37 
 
 
439 aa  43.1  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  27.57 
 
 
519 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 
423 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 
486 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  19.25 
 
 
446 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.37 
 
 
452 aa  43.1  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
488 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  26.64 
 
 
519 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  26.64 
 
 
519 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>