More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1654 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  100 
 
 		 473 aa  929    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  65.92 
 
 		 454 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  60.78 
 
 		 467 aa  560  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  60.4 
 
 		 455 aa  545  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  42.73 
 
 		 478 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  47.46 
 
 		 470 aa  391  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  41.69 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  42.02 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  42.25 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  40.9 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  42.02 
 
 		 457 aa  361  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  40.78 
 
 		 458 aa  332  7.000000000000001e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  39.37 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  40.05 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  40.28 
 
 		 437 aa  317  4e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  54.84 
 
 		 190 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  30.95 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  30.63 
 
 		 475 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  29.29 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 447 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29.79 
 
 		 455 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 456 aa  156  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 467 aa  147  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  38.54 
 
 		 210 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 525 aa  144  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 481 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 554 aa  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.63 
 
 		 462 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  28.25 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  31.41 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  27.69 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 439 aa  133  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 454 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 462 aa  130  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 447 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  30.26 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.57 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 451 aa  128  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  29.02 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 538 aa  126  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 470 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 475 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.23 
 
 		 456 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  28.1 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 485 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 447 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  25.85 
 
 		 451 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 448 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.6 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  29.47 
 
 		 454 aa  118  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 461 aa  116  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.09 
 
 		 475 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.99 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  32.12 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  32.12 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>