More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1579 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  100 
 
 		 445 aa  870    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  42.21 
 
 		 463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  32.51 
 
 		 461 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  31.68 
 
 		 500 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  34.34 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  31.9 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 485 aa  201  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 460 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  31.67 
 
 		 461 aa  199  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  32.06 
 
 		 475 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 486 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 518 aa  192  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 475 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  30.79 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 468 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  31.51 
 
 		 525 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 554 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 490 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 458 aa  173  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 453 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 469 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 461 aa  170  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 468 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 462 aa  167  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 538 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.28 
 
 		 469 aa  160  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.28 
 
 		 469 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.28 
 
 		 469 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 469 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.5 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.5 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 467 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 448 aa  157  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 443 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.5 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  30.26 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 453 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.5 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 483 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 450 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 466 aa  147  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 480 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  29 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.57 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 455 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 455 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 451 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  28.26 
 
 		 452 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.64 
 
 		 496 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  28.76 
 
 		 521 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  28.57 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>