More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2029 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  100 
 
 
455 aa  896    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  59.16 
 
 
454 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  59.06 
 
 
467 aa  555  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  60.4 
 
 
473 aa  547  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  42.13 
 
 
478 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  40.89 
 
 
485 aa  365  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  41.2 
 
 
460 aa  359  6e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  42.04 
 
 
460 aa  358  9e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  41.9 
 
 
460 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  42 
 
 
457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  44 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  38.94 
 
 
458 aa  313  4.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  39.49 
 
 
437 aa  307  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  39.72 
 
 
437 aa  307  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  36.47 
 
 
454 aa  305  9.000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  59.14 
 
 
190 aa  233  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.38 
 
 
460 aa  196  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28 
 
 
455 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.89 
 
 
461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
459 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.79 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  37.82 
 
 
210 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.08 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.95 
 
 
451 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
447 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
448 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  30.21 
 
 
467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
447 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
468 aa  133  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.23 
 
 
477 aa  129  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.5 
 
 
485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.53 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
458 aa  127  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.9 
 
 
439 aa  126  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  27.64 
 
 
467 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
462 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.55 
 
 
461 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  26.73 
 
 
453 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.89 
 
 
458 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.79 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  28.93 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  28.79 
 
 
478 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
454 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.58 
 
 
477 aa  119  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.92 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.56 
 
 
451 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
470 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  26.09 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  26.27 
 
 
456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.16 
 
 
451 aa  116  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
452 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
498 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  24.41 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  28.21 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.57 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
461 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
440 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.2 
 
 
484 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
451 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.83 
 
 
466 aa  113  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.92 
 
 
455 aa  113  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
455 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  25.35 
 
 
456 aa  113  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.19 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24 
 
 
470 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  27.02 
 
 
440 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.66 
 
 
442 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.86 
 
 
496 aa  110  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.56 
 
 
460 aa  110  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
460 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.35 
 
 
525 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25 
 
 
518 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
463 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.61 
 
 
554 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  27.06 
 
 
470 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.86 
 
 
468 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  24.51 
 
 
445 aa  107  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25 
 
 
455 aa  106  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  23.63 
 
 
538 aa  106  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.54 
 
 
460 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
445 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  27.89 
 
 
454 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.18 
 
 
467 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
449 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>