More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1454 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  100 
 
 
477 aa  942    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  37.47 
 
 
462 aa  300  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  36.59 
 
 
468 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  34.35 
 
 
455 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  34.57 
 
 
462 aa  251  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  34.35 
 
 
448 aa  251  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  32.9 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  32.08 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  30.56 
 
 
554 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  31.49 
 
 
500 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  32.24 
 
 
454 aa  224  2e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  31.59 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  29.38 
 
 
538 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  30.39 
 
 
499 aa  221  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  30.92 
 
 
451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  30.08 
 
 
500 aa  220  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  28.14 
 
 
453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  30.74 
 
 
525 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.25 
 
 
500 aa  209  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  29.58 
 
 
485 aa  208  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.82 
 
 
481 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.91 
 
 
518 aa  200  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  28.69 
 
 
498 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.69 
 
 
490 aa  193  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  30.82 
 
 
470 aa  193  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  30.27 
 
 
505 aa  190  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.42 
 
 
460 aa  189  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
460 aa  179  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.45 
 
 
461 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.97 
 
 
469 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.27 
 
 
475 aa  173  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  27.33 
 
 
469 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  27.33 
 
 
469 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  27.33 
 
 
469 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  28.06 
 
 
469 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  27.33 
 
 
469 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.83 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.24 
 
 
469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.16 
 
 
475 aa  163  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.39 
 
 
469 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
471 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.98 
 
 
458 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.92 
 
 
464 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
461 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  28.86 
 
 
472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  29.83 
 
 
460 aa  156  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
458 aa  156  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.77 
 
 
455 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  30.52 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.16 
 
 
467 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  26.85 
 
 
467 aa  151  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
469 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
469 aa  150  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  30.47 
 
 
438 aa  149  9e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.11 
 
 
454 aa  147  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
467 aa  147  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  27.44 
 
 
455 aa  147  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
464 aa  146  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.98 
 
 
496 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
460 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.02 
 
 
452 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
524 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
454 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
437 aa  144  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
467 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
455 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.5 
 
 
470 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.68 
 
 
451 aa  142  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  28.32 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  24.07 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
477 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  28.27 
 
 
451 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.86 
 
 
448 aa  139  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  29.56 
 
 
456 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
461 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  26.8 
 
 
456 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  28.86 
 
 
449 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
466 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.72 
 
 
478 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
484 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  28.63 
 
 
473 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.78 
 
 
463 aa  137  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.51 
 
 
455 aa  136  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  26.12 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>