More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1597 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  100 
 
 
460 aa  909    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  50.55 
 
 
453 aa  424  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  32.35 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.89 
 
 
486 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.89 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.98 
 
 
460 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  30.68 
 
 
454 aa  216  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  29.98 
 
 
500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.34 
 
 
518 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  30.08 
 
 
498 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.39 
 
 
470 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.57 
 
 
490 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
499 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  29.05 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  31.17 
 
 
448 aa  196  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.84 
 
 
468 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.17 
 
 
525 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  29.42 
 
 
469 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  29.42 
 
 
469 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.61 
 
 
496 aa  189  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  29.32 
 
 
469 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  29.32 
 
 
469 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  29.32 
 
 
469 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  28.23 
 
 
462 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  27.02 
 
 
492 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.32 
 
 
469 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29.32 
 
 
469 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.93 
 
 
481 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  28.98 
 
 
469 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  29.32 
 
 
469 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
469 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  29.32 
 
 
469 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  27.04 
 
 
471 aa  183  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  27.67 
 
 
455 aa  183  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  27.87 
 
 
472 aa  183  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  27.85 
 
 
486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
455 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
455 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  29.64 
 
 
457 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
470 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  30.07 
 
 
469 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  29.91 
 
 
469 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  29.25 
 
 
459 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  28.03 
 
 
482 aa  176  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  27.09 
 
 
491 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  29.2 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  30.02 
 
 
446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28.39 
 
 
538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.12 
 
 
554 aa  173  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
494 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.49 
 
 
485 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
521 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.49 
 
 
500 aa  171  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.9 
 
 
462 aa  170  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  28.92 
 
 
454 aa  169  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
480 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.87 
 
 
462 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  28.87 
 
 
463 aa  168  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  27.93 
 
 
476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
524 aa  164  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.18 
 
 
454 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  30.08 
 
 
503 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
500 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
443 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
448 aa  160  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
438 aa  159  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  25.64 
 
 
446 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  27.87 
 
 
436 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  28.47 
 
 
478 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
505 aa  156  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
475 aa  156  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
464 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
451 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
451 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.28 
 
 
454 aa  153  7e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26.12 
 
 
453 aa  152  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
460 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
461 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.66 
 
 
484 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.82 
 
 
463 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
449 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  30.05 
 
 
460 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.52 
 
 
461 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  29.48 
 
 
445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  23.6 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.44 
 
 
458 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  23.69 
 
 
463 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  22.4 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  29.5 
 
 
453 aa  147  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.25 
 
 
475 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.41 
 
 
477 aa  146  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.29 
 
 
456 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  25.34 
 
 
449 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  23.36 
 
 
453 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
455 aa  144  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>