More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0997 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  100 
 
 		 437 aa  857    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  99.31 
 
 		 437 aa  852    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  51.49 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  48.05 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  46.82 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  45.68 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  45.91 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  45 
 
 		 458 aa  362  1e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  41.24 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  41.24 
 
 		 478 aa  336  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  39.68 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  40.28 
 
 		 473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  39.12 
 
 		 454 aa  292  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  39.72 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  39.72 
 
 		 470 aa  281  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  33.95 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  29.82 
 
 		 451 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  31.8 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 442 aa  153  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  31.49 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 461 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  30.1 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 455 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  37.97 
 
 		 190 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  28.19 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 454 aa  139  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 451 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 451 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 451 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  25.63 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.37 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  29 
 
 		 477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  35.18 
 
 		 210 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  25.4 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  25.4 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 440 aa  133  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 447 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  26.51 
 
 		 451 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 467 aa  129  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 445 aa  129  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  29.17 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.09 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.16 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 454 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25.58 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 458 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  28.46 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 475 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  26.28 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5728  hypothetical protein  27.49 
 
 		 470 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26 
 
 		 475 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 538 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  24.94 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 446 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>