More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1180 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  100 
 
 		 455 aa  904    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  46.26 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  40.36 
 
 		 448 aa  336  5.999999999999999e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  36.89 
 
 		 468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 499 aa  259  9e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.54 
 
 		 485 aa  246  6.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  32.82 
 
 		 486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  34.52 
 
 		 477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  31.35 
 
 		 454 aa  236  8e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  30.66 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 500 aa  222  9e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  31.19 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  31.15 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  30.04 
 
 		 538 aa  216  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 490 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29 
 
 		 481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 485 aa  210  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 554 aa  206  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 475 aa  166  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.56 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 475 aa  160  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 464 aa  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 464 aa  153  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.78 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 468 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 460 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.24 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  26.48 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  26.48 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  26.48 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  26.48 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  26.48 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  29.9 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  26.24 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 469 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 469 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 468 aa  143  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  30.54 
 
 		 458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 438 aa  140  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 445 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  25.69 
 
 		 436 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 453 aa  136  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  28.39 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 467 aa  134  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  23.86 
 
 		 492 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  24.15 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  24.89 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 480 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  24.87 
 
 		 462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 471 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 460 aa  128  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 458 aa  127  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 453 aa  126  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 455 aa  126  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>