More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1582 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 
467 aa  928    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  46.41 
 
 
455 aa  414  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  33.77 
 
 
451 aa  262  8e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  32.39 
 
 
472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.14 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  31.17 
 
 
467 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  28.38 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.91 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  29.77 
 
 
477 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  31.31 
 
 
447 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  30.84 
 
 
449 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.14 
 
 
447 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  28.76 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  26.79 
 
 
456 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  29.81 
 
 
455 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.69 
 
 
447 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  29.31 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.96 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  29.43 
 
 
451 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
439 aa  171  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.49 
 
 
466 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
448 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
461 aa  170  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  27.9 
 
 
496 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  29.58 
 
 
452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  28.41 
 
 
454 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
456 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
449 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.87 
 
 
451 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
454 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.23 
 
 
455 aa  153  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  26.77 
 
 
470 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  25.11 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  28.18 
 
 
467 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  28.33 
 
 
459 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.77 
 
 
454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  26.89 
 
 
461 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  26.48 
 
 
448 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
458 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
466 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  27.07 
 
 
448 aa  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25.06 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  27.43 
 
 
442 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.98 
 
 
447 aa  140  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
493 aa  140  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.05 
 
 
465 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  25.27 
 
 
452 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.47 
 
 
466 aa  137  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  26.89 
 
 
456 aa  137  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  25.36 
 
 
450 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  28.72 
 
 
466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
460 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  27.72 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  26.82 
 
 
456 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  26.13 
 
 
449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  26.74 
 
 
443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
462 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  25.76 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  26.36 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  23.34 
 
 
464 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  24.72 
 
 
451 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  24.72 
 
 
451 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25.69 
 
 
464 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  26.97 
 
 
450 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  26.97 
 
 
450 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  26.79 
 
 
450 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  27 
 
 
448 aa  124  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  23.78 
 
 
446 aa  123  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.27 
 
 
451 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.43 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  26.81 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  24.89 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
460 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1477  MATE efflux family protein  25.47 
 
 
462 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  28.02 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  26.3 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.81 
 
 
437 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  25.97 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  26.4 
 
 
468 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  27.78 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2170  multi anti extrusion protein MatE  26.95 
 
 
546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.044702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  23.91 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2309  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 
541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.324843  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  24.63 
 
 
478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
444 aa  110  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  26.35 
 
 
451 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  26.11 
 
 
451 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2206  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.26 
 
 
541 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.711563  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  27.65 
 
 
454 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.14 
 
 
451 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  23.15 
 
 
451 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  23.59 
 
 
462 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
452 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  23.33 
 
 
451 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>