More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0548 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  100 
 
 		 459 aa  916    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  35.2 
 
 		 451 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  35.43 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 452 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  35.2 
 
 		 451 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  34.97 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  34.97 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  34.67 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  34.2 
 
 		 451 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  34.2 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  33.96 
 
 		 451 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  33.17 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  32.77 
 
 		 440 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  33.01 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  34.29 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  34.21 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  30.8 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.89 
 
 		 496 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  32 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  31.41 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  30.52 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  28.73 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.48 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  31.36 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 451 aa  202  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  28.38 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  31.63 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  33.02 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  31.82 
 
 		 458 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 442 aa  195  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  31.98 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  30.59 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  30.37 
 
 		 450 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  30.37 
 
 		 450 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  31.75 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  31.43 
 
 		 451 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  30.14 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  31.43 
 
 		 451 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  29.88 
 
 		 450 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  30.71 
 
 		 454 aa  190  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  31.73 
 
 		 449 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.19 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  31.17 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.05 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  30.95 
 
 		 451 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  31.28 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  31.68 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  32.23 
 
 		 447 aa  183  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 447 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  30.59 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  30.49 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.81 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  30.72 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  29.5 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 456 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.72 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.06 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  29.76 
 
 		 455 aa  176  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  29.32 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  30.2 
 
 		 464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  30.27 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  29.9 
 
 		 461 aa  169  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.89 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  29.12 
 
 		 496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.42 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  29.23 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  27.67 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  32.05 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  30.71 
 
 		 455 aa  162  9e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  25.88 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  27.42 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  29.65 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  31.13 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  27.68 
 
 		 461 aa  157  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  32.12 
 
 		 442 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.05 
 
 		 472 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 460 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 466 aa  147  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  26.82 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 460 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 457 aa  144  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 490 aa  144  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 454 aa  143  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  28.33 
 
 		 455 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 493 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>