More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0400 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  100 
 
 
456 aa  904    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  41.19 
 
 
449 aa  326  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  40.65 
 
 
455 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  38.16 
 
 
455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  38.62 
 
 
454 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  37.56 
 
 
456 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  39.46 
 
 
454 aa  295  8e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  38.11 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  37.78 
 
 
456 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  36.16 
 
 
455 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  36.16 
 
 
455 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  37.5 
 
 
477 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  37.07 
 
 
442 aa  277  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  34.76 
 
 
496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  36.43 
 
 
493 aa  257  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  36.88 
 
 
447 aa  256  8e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  36.41 
 
 
449 aa  255  9e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  35.7 
 
 
447 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  36.13 
 
 
461 aa  249  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  32.26 
 
 
448 aa  247  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  32.5 
 
 
466 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  38.12 
 
 
454 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  33.71 
 
 
466 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  32.74 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  31.92 
 
 
460 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  33.04 
 
 
466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  33.33 
 
 
451 aa  230  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  33.92 
 
 
461 aa  226  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  34.55 
 
 
447 aa  224  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  32.04 
 
 
460 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  31.37 
 
 
451 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  28.15 
 
 
451 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  27.7 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  31.96 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  27.93 
 
 
451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.6 
 
 
451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  28.09 
 
 
448 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
452 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  32.49 
 
 
455 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
451 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.33 
 
 
451 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
451 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27.66 
 
 
451 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.11 
 
 
451 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  29.38 
 
 
452 aa  210  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  33.05 
 
 
466 aa  209  7e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  32.29 
 
 
470 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.96 
 
 
447 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  29.87 
 
 
462 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.7 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  30.38 
 
 
452 aa  199  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  31.24 
 
 
451 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  28.92 
 
 
496 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  30.63 
 
 
439 aa  197  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  29.3 
 
 
448 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  29.14 
 
 
448 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  29.55 
 
 
446 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.75 
 
 
472 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
460 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  28.88 
 
 
464 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
450 aa  188  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  28.21 
 
 
467 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  29.31 
 
 
440 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  27.83 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.88 
 
 
458 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
459 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  29.21 
 
 
440 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  26.79 
 
 
445 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.58 
 
 
451 aa  171  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  29.23 
 
 
442 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  28.94 
 
 
451 aa  169  7e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.89 
 
 
467 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.01 
 
 
446 aa  167  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  27.93 
 
 
449 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  26.16 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.19 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.17 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  28.21 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  25.89 
 
 
465 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  25.57 
 
 
472 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  26.32 
 
 
459 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  27.92 
 
 
440 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  28.29 
 
 
452 aa  161  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
448 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
456 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  27.4 
 
 
444 aa  159  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
456 aa  157  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  29.6 
 
 
459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  26.12 
 
 
449 aa  156  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.82 
 
 
468 aa  156  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  25.28 
 
 
442 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.32 
 
 
451 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.32 
 
 
451 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  25.6 
 
 
464 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.2 
 
 
447 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  26.11 
 
 
443 aa  149  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  25.44 
 
 
451 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.09 
 
 
452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.44 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
461 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>