More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3000 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  75 
 
 		 448 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  73.47 
 
 		 448 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  72.95 
 
 		 449 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  72.79 
 
 		 449 aa  654    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  100 
 
 		 458 aa  921    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  72.13 
 
 		 451 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  73.74 
 
 		 450 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  73.74 
 
 		 450 aa  661    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  71.91 
 
 		 451 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  73.85 
 
 		 450 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  71.91 
 
 		 451 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  71.91 
 
 		 451 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  66.44 
 
 		 456 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  66.9 
 
 		 443 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  34.69 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  36.53 
 
 		 496 aa  253  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  32.11 
 
 		 448 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  33.33 
 
 		 448 aa  249  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  32.5 
 
 		 465 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  30.93 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  32.54 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  32.79 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  34.12 
 
 		 467 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  31.14 
 
 		 459 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  29.95 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  32.68 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  32.49 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  31.95 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  31.95 
 
 		 455 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  31.05 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  29.13 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  31.4 
 
 		 456 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  30.39 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  31.82 
 
 		 459 aa  196  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  29.31 
 
 		 455 aa  193  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  29.16 
 
 		 455 aa  193  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  30.61 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  31.75 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  28.4 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  27.84 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  28.07 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  27.61 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 451 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 451 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  28.27 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  27.84 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 449 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  31.48 
 
 		 447 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 466 aa  176  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 451 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  30.87 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.02 
 
 		 455 aa  169  9e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.43 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  30.83 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  27.78 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.08 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.79 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  26.03 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  29.27 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  31.3 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 454 aa  152  8e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  30.83 
 
 		 464 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  31.55 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  28.12 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 447 aa  150  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.71 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 493 aa  143  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  27.23 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.34 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  27.53 
 
 		 496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  27.17 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  28.91 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.49 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  27.32 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 445 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.2 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>