More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2669 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 
452 aa  867    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  43.3 
 
 
445 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  38.93 
 
 
434 aa  325  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  36.58 
 
 
440 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  35.81 
 
 
442 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  33.49 
 
 
445 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  31.75 
 
 
440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  29.53 
 
 
459 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  33.01 
 
 
451 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  32.52 
 
 
451 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  32.49 
 
 
452 aa  223  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  32.04 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  32.04 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  32.04 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  32.04 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  32.04 
 
 
451 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  32.52 
 
 
451 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  32.28 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1225  multi anti extrusion protein MatE  33.11 
 
 
439 aa  208  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.874219  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  33.33 
 
 
435 aa  189  8e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.53 
 
 
452 aa  183  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
451 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.98 
 
 
437 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.21 
 
 
446 aa  166  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
451 aa  161  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  29.09 
 
 
456 aa  161  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  32.12 
 
 
446 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  28.9 
 
 
448 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.31 
 
 
450 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  29.15 
 
 
461 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  28.54 
 
 
467 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
448 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.08 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  28.16 
 
 
446 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.26 
 
 
451 aa  149  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.34 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  31.73 
 
 
456 aa  143  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  25.06 
 
 
452 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.64 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.28 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  27.15 
 
 
450 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.75 
 
 
454 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.9 
 
 
455 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  27.17 
 
 
468 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.47 
 
 
458 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  28.3 
 
 
448 aa  137  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  29.81 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  29.81 
 
 
451 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  30.05 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  30.05 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.8 
 
 
455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  29.81 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  25 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.78 
 
 
461 aa  133  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.81 
 
 
450 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
455 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  24.37 
 
 
444 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  26.68 
 
 
464 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.41 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.81 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  29.81 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  25.62 
 
 
465 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  23.25 
 
 
455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  22.74 
 
 
455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.31 
 
 
448 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  29.81 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.76 
 
 
443 aa  128  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  29.34 
 
 
461 aa  128  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  21.95 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  28.2 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  23.7 
 
 
447 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  23.59 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  24.76 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  24.28 
 
 
451 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  25.85 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25 
 
 
449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  21.95 
 
 
456 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  30.36 
 
 
455 aa  117  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  26.57 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
447 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  23.9 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  24.26 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.18 
 
 
472 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  28.39 
 
 
485 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
454 aa  106  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  26.28 
 
 
470 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  24.94 
 
 
439 aa  103  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  23.26 
 
 
452 aa  101  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  23.85 
 
 
439 aa  101  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
452 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2061  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.67 
 
 
560 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.488699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.28 
 
 
478 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  23.87 
 
 
451 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.84 
 
 
466 aa  98.6  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  22.17 
 
 
472 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>