More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0255 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  100 
 
 
448 aa  874    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  33.57 
 
 
454 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  32.27 
 
 
455 aa  229  9e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  32.79 
 
 
455 aa  227  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  30.5 
 
 
456 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  32.43 
 
 
449 aa  223  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
455 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  32.26 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  30.13 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  30.5 
 
 
456 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  31.05 
 
 
442 aa  219  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  33.48 
 
 
454 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.11 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  30.04 
 
 
447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  29.62 
 
 
455 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
449 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  29.05 
 
 
455 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  30.49 
 
 
452 aa  205  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  31.56 
 
 
470 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  34.16 
 
 
454 aa  201  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  29.68 
 
 
493 aa  200  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  29.49 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  32.79 
 
 
461 aa  194  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  32.43 
 
 
448 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  31.08 
 
 
477 aa  193  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  30.66 
 
 
451 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  31.75 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  31.06 
 
 
451 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.48 
 
 
496 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
447 aa  188  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  31.35 
 
 
448 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  31.68 
 
 
450 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  31.68 
 
 
450 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  29.28 
 
 
496 aa  186  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  31.76 
 
 
450 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  29.27 
 
 
465 aa  186  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  29.47 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  31.88 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  31.88 
 
 
451 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.06 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.25 
 
 
448 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  27.66 
 
 
448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  29.01 
 
 
460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  31.38 
 
 
467 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  29.98 
 
 
466 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.27 
 
 
460 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  32.25 
 
 
449 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  31.88 
 
 
451 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.98 
 
 
455 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  30.32 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  30.09 
 
 
451 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.88 
 
 
451 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  28.83 
 
 
452 aa  179  7e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  29.86 
 
 
451 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  29.86 
 
 
451 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  29.86 
 
 
451 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  29.86 
 
 
451 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
450 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  29.86 
 
 
451 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  29.86 
 
 
451 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  29.86 
 
 
451 aa  177  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  30.09 
 
 
452 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.41 
 
 
461 aa  176  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.15 
 
 
447 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  28.4 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  28.09 
 
 
446 aa  173  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
459 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  29.83 
 
 
449 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  27.19 
 
 
472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  26.19 
 
 
442 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
451 aa  162  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
440 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  30.53 
 
 
456 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  28.34 
 
 
447 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.18 
 
 
460 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  29.78 
 
 
443 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  26.67 
 
 
453 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
456 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  27.43 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  28.61 
 
 
445 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  30.27 
 
 
459 aa  150  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.6 
 
 
472 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  27.69 
 
 
452 aa  149  9e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  28.21 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  26.07 
 
 
440 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  29.47 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  26.97 
 
 
445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.45 
 
 
434 aa  144  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.37 
 
 
461 aa  144  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  28.4 
 
 
446 aa  143  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
454 aa  143  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  29.87 
 
 
467 aa  143  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  31.95 
 
 
445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  28.92 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  27 
 
 
455 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  27.15 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.43 
 
 
452 aa  139  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>