More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2656 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  100 
 
 		 455 aa  897    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  44.12 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  43.14 
 
 		 455 aa  350  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  43.2 
 
 		 455 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  43.2 
 
 		 455 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  43.27 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  39.45 
 
 		 442 aa  325  9e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  39.38 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  40.85 
 
 		 454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  39.91 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  38.27 
 
 		 456 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  38.04 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  36.83 
 
 		 449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  38.48 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  36.57 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  36.12 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  36.62 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  38.46 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  38.36 
 
 		 447 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  36.32 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  38.11 
 
 		 456 aa  266  7e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  37.5 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  33.92 
 
 		 448 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  32.6 
 
 		 493 aa  250  5e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  35.32 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  34.63 
 
 		 451 aa  247  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  35.71 
 
 		 455 aa  243  7e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  33.12 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  32.24 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  32.53 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  34.52 
 
 		 451 aa  240  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  36.87 
 
 		 466 aa  240  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  31.26 
 
 		 452 aa  236  6e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  34.91 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  31.25 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  32.01 
 
 		 452 aa  232  9e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  35.63 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  32.37 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 448 aa  223  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  30.47 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  28.83 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  30.41 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  30.75 
 
 		 496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  28.86 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  30.47 
 
 		 446 aa  212  9e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  32.67 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.29 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  32.81 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  31 
 
 		 456 aa  209  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  32.73 
 
 		 470 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  33.72 
 
 		 451 aa  203  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.59 
 
 		 450 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.59 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  29.36 
 
 		 450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.84 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.84 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 440 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.76 
 
 		 467 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  30.8 
 
 		 449 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  30.52 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.77 
 
 		 449 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.62 
 
 		 451 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  28.35 
 
 		 465 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  27.06 
 
 		 443 aa  193  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 440 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  29.12 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 451 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.39 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  29.12 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 452 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  28.89 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  28.54 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  27.9 
 
 		 448 aa  187  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  29.44 
 
 		 459 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  30.55 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  28.48 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  31.45 
 
 		 464 aa  177  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  30 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  30.71 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  30.99 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.77 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  25.5 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>