More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3704 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  984    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  55.73 
 
 		 467 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  49.55 
 
 		 451 aa  435  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  35.92 
 
 		 450 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  36.38 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  35.92 
 
 		 450 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  35.88 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  37.24 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  36.28 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  35.76 
 
 		 451 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  35.76 
 
 		 451 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  34.55 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  35.63 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 448 aa  277  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  36.83 
 
 		 443 aa  277  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  36.41 
 
 		 449 aa  276  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  33.79 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36 
 
 		 451 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  33.56 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  35.76 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  36.53 
 
 		 458 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  36.54 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  31.84 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  33.57 
 
 		 446 aa  259  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  35.1 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  32.31 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  33.86 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  30.75 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  32.3 
 
 		 447 aa  240  5e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  31.18 
 
 		 454 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  31.36 
 
 		 456 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  29.69 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  32.44 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  32.67 
 
 		 447 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  32.89 
 
 		 449 aa  232  9e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  29.56 
 
 		 451 aa  230  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 452 aa  229  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 451 aa  229  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 451 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  29.33 
 
 		 451 aa  228  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  31.36 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  29.23 
 
 		 451 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  29 
 
 		 451 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 445 aa  226  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 451 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  28.87 
 
 		 451 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  29.89 
 
 		 459 aa  220  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 455 aa  219  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  30 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 456 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  31.64 
 
 		 442 aa  206  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  30.99 
 
 		 440 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  31.47 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 461 aa  199  9e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  29.84 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  27.62 
 
 		 496 aa  196  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 460 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  30.57 
 
 		 455 aa  192  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.01 
 
 		 447 aa  190  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.9 
 
 		 467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.49 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  32.61 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 456 aa  177  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 461 aa  177  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  30.39 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.4 
 
 		 434 aa  172  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  27.27 
 
 		 466 aa  171  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  25.79 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.89 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.05 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  29.71 
 
 		 466 aa  163  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.25 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 470 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  26.46 
 
 		 455 aa  156  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 460 aa  153  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 454 aa  153  8e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30 
 
 		 451 aa  152  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.95 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 460 aa  150  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>