More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0185 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  100 
 
 		 449 aa  872    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  74.22 
 
 		 447 aa  635    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  93.05 
 
 		 447 aa  821    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  92.83 
 
 		 447 aa  823    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  45.05 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  46.06 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  39.07 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  40.19 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  40.19 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  37.56 
 
 		 455 aa  295  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  37.44 
 
 		 454 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  38.52 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  37.28 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  40.38 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  37.41 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  36.45 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  36.52 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  34.34 
 
 		 442 aa  255  9e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  36.19 
 
 		 456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  33.8 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  36.41 
 
 		 455 aa  236  7e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  34.93 
 
 		 451 aa  236  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  32.58 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  36.22 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  35.07 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  34.72 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  31.21 
 
 		 448 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  36.41 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  31.71 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  31.71 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  32.89 
 
 		 496 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  34.69 
 
 		 462 aa  219  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  32.46 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  29.62 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  31.14 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  35.1 
 
 		 466 aa  210  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 447 aa  210  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  30.33 
 
 		 452 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  35.38 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  33.02 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 466 aa  199  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  28.93 
 
 		 472 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  32.18 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  32.89 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  29.87 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.84 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  30.44 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  28.03 
 
 		 466 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  32.37 
 
 		 447 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  31.87 
 
 		 472 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  31.75 
 
 		 456 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  31.91 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  28.32 
 
 		 493 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  29.74 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  29.56 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  28 
 
 		 451 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  28.24 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  31.32 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.8 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  28 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  27.76 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  30.17 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  30.34 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  30.6 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  31.47 
 
 		 451 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  29.76 
 
 		 455 aa  173  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  32.59 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  28.63 
 
 		 485 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  32.19 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.93 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  28.4 
 
 		 459 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4280  MATE efflux family protein  30.42 
 
 		 445 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361328  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  28.28 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  27.75 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 450 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.57 
 
 		 443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.91 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.91 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  28.44 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27.34 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>