More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1655 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 		 450 aa  891    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  74.89 
 
 		 451 aa  658    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  43.38 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  41.03 
 
 		 455 aa  299  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 442 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  32.94 
 
 		 440 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  30.28 
 
 		 451 aa  206  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  32.61 
 
 		 445 aa  202  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  29.86 
 
 		 451 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 451 aa  199  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  29.86 
 
 		 451 aa  199  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  29.62 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  29.58 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.3 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  29.34 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 452 aa  172  9e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 448 aa  163  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  28.67 
 
 		 496 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  28.67 
 
 		 448 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  28.78 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.63 
 
 		 448 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.61 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.35 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  28.24 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  30 
 
 		 467 aa  147  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.59 
 
 		 455 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.26 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  29.7 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.41 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 455 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  26.88 
 
 		 468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  28.72 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  25.34 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  27.03 
 
 		 464 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  24.47 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.31 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 466 aa  126  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  25.45 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  25.45 
 
 		 451 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  28.29 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.88 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  27.8 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 448 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 449 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  28.34 
 
 		 450 aa  123  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.6 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  28.34 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.34 
 
 		 449 aa  123  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.6 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  26.06 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  23.08 
 
 		 443 aa  120  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 439 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 447 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 450 aa  119  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.4 
 
 		 465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 460 aa  113  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 455 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  23.39 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  23.65 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  24.05 
 
 		 496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  25.24 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  25.7 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 454 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  23.77 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  22.56 
 
 		 458 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 454 aa  106  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  24.05 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 456 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  26.63 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  25.12 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>