More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1218 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  96.52 
 
 		 460 aa  884    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  100 
 
 		 464 aa  917    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  54.76 
 
 		 460 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  55.23 
 
 		 466 aa  444  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  46.36 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  43.58 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  39.34 
 
 		 455 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  39.21 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  39.31 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  38.65 
 
 		 455 aa  289  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  37.44 
 
 		 454 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  38.96 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  40.23 
 
 		 456 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  40.13 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  35.19 
 
 		 455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  38.7 
 
 		 455 aa  261  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  35.65 
 
 		 447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  34.89 
 
 		 442 aa  253  6e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  34.9 
 
 		 448 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  34.35 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  35.42 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  32.41 
 
 		 466 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  35.56 
 
 		 455 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  34.72 
 
 		 449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  33.64 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  33.12 
 
 		 493 aa  226  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  35.01 
 
 		 447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  32.03 
 
 		 496 aa  214  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.74 
 
 		 472 aa  209  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 456 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  34.64 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  30.32 
 
 		 452 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  32.9 
 
 		 462 aa  199  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  30.26 
 
 		 451 aa  199  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  30.05 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  30.84 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  35.04 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  29.71 
 
 		 496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.7 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  30.2 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  30.4 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  31.48 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  28.86 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  31.76 
 
 		 470 aa  177  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  31.07 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  28.43 
 
 		 467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  30.85 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.64 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  30.95 
 
 		 455 aa  173  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.09 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 451 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 439 aa  170  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  29.07 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  28.84 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  29.51 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  28.92 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  29 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  27.85 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  30.88 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  28.12 
 
 		 454 aa  163  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  29.31 
 
 		 465 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  27.92 
 
 		 472 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  27.66 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 472 aa  160  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  30.83 
 
 		 458 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  28.64 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  27.05 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.22 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  28.25 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  28.4 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  30.03 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  28.4 
 
 		 450 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.11 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  27.42 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  30.29 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 456 aa  153  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.48 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.77 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.77 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  26.34 
 
 		 451 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.34 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  24.82 
 
 		 451 aa  142  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  27.14 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.71 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>