More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0795 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  74.89 
 
 		 450 aa  673    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  100 
 
 		 451 aa  893    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  46.24 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  40.37 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  31 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  30.48 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  29.84 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  29.6 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  29.37 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  29.14 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 452 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  28.9 
 
 		 451 aa  179  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  28.67 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.17 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  30.56 
 
 		 452 aa  156  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.54 
 
 		 455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.88 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  30 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.28 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  27.94 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  29.37 
 
 		 435 aa  140  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  28.67 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  26.57 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.49 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25.76 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 447 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  27.09 
 
 		 460 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.7 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  24.76 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  25.79 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  26.86 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  25.11 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  25.5 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  25.5 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.26 
 
 		 452 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  24.83 
 
 		 443 aa  122  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.28 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  25.28 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  25.91 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  25.62 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.57 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  25.62 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  27.96 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  24.26 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  25.4 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  27.12 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 490 aa  113  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  27.53 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  26.8 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.65 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  27.43 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  29.94 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.68 
 
 		 496 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  23.56 
 
 		 449 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  25.06 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25.65 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 455 aa  106  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 456 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>