289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0874 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  100 
 
 		 439 aa  858    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  49.42 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  48.85 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  29.06 
 
 		 490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 451 aa  157  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 447 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  26.16 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  31.56 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  25.58 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25.81 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  27.56 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  25.89 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  26.89 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  26.89 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.05 
 
 		 456 aa  126  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 451 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  27.17 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  25.74 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  26.41 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  25.06 
 
 		 448 aa  124  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 452 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 451 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.64 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  26.1 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  26.23 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 447 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 455 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  27.17 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  25.81 
 
 		 461 aa  113  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.75 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.7 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  25.9 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 461 aa  109  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.4 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  25.44 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.29 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  23.5 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  27.11 
 
 		 468 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  27.27 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 466 aa  104  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.16 
 
 		 451 aa  103  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  26.91 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  26.91 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  25.84 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 442 aa  100  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  24.63 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  26.34 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.83 
 
 		 437 aa  97.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 447 aa  96.7  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 452 aa  96.3  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 439 aa  96.3  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  25.49 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 456 aa  94.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.44 
 
 		 496 aa  94.4  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 460 aa  94  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 470 aa  94  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.53 
 
 		 449 aa  94  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.17 
 
 		 447 aa  93.6  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 456 aa  93.6  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1894  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 447 aa  93.6  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000130161  unclonable  2.59167e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.78 
 
 		 451 aa  93.2  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.78 
 
 		 451 aa  93.2  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  29.21 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  29.21 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  23.09 
 
 		 466 aa  90.1  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 461 aa  90.1  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 454 aa  90.1  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2061  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  26.19 
 
 		 560 aa  89.7  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.488699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  28.05 
 
 		 448 aa  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25.78 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.94 
 
 		 452 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>