More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0373 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0373  MATE efflux family protein  100 
 
 		 490 aa  990    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  36.47 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0585  MATE efflux family protein, authentic frameshift  30.51 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.636807  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0874  putative integral membrane protein  29.06 
 
 		 439 aa  148  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.512566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 459 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 450 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  24.65 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  24.83 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  24.59 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 451 aa  133  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  24.13 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.68 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.68 
 
 		 451 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.5 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 448 aa  127  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 442 aa  126  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.12 
 
 		 467 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  26.67 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  26.67 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.34 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  24.55 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  27.47 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.68 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  27.57 
 
 		 496 aa  123  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.07 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  24.32 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  25.18 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 447 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  27.12 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  23.25 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  25.23 
 
 		 443 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25.28 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  23.76 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  22.99 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  26.88 
 
 		 440 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 454 aa  110  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.43 
 
 		 434 aa  109  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 466 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  23.78 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  24.54 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  23.73 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 493 aa  106  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  23.54 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  25.54 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.32 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.38 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  22.77 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  22.91 
 
 		 451 aa  101  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.1 
 
 		 450 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  22.08 
 
 		 460 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  23 
 
 		 440 aa  99.8  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  22.1 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 447 aa  99.8  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 456 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  23.71 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  26.01 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 437 aa  97.8  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  23.03 
 
 		 454 aa  97.8  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  23.93 
 
 		 459 aa  96.7  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  25.4 
 
 		 451 aa  96.7  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  22.96 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  23.42 
 
 		 437 aa  95.9  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.98 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 460 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 467 aa  94.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03710  Na+-driven multidrug efflux pump  22.44 
 
 		 456 aa  94  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.323146  normal  0.0291298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>