More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2060 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  100 
 
 		 456 aa  906    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  51.56 
 
 		 461 aa  448  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  45.49 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  37.56 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  32.31 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  30.24 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.96 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  31 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  31.8 
 
 		 447 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 447 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  30.5 
 
 		 454 aa  186  9e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  32.03 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.84 
 
 		 456 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  30.18 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 455 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 455 aa  176  9e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  29 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 442 aa  170  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  28.79 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.14 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 460 aa  167  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26 
 
 		 500 aa  163  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 448 aa  162  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  28.45 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25.92 
 
 		 463 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.68 
 
 		 452 aa  156  7e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 525 aa  156  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 452 aa  156  9e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.69 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  28.54 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.41 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  25.72 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 518 aa  151  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 538 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  27.64 
 
 		 464 aa  150  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 484 aa  149  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 473 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.21 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  29 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  23.79 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.48 
 
 		 461 aa  143  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.14 
 
 		 485 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  28.86 
 
 		 451 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  26.3 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  22.71 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 554 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 470 aa  140  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  25.66 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.68 
 
 		 496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 440 aa  136  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 450 aa  136  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  24.59 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 437 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.96 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.13 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 466 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  28.04 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  25.81 
 
 		 496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  26.47 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.33 
 
 		 469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  27.33 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  27.33 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  27.33 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 452 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>