More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1199 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  100 
 
 
450 aa  890    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  32.66 
 
 
458 aa  237  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  31.69 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  31.41 
 
 
459 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  31.58 
 
 
475 aa  226  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  30.68 
 
 
452 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  29.05 
 
 
469 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  29.93 
 
 
464 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  29.93 
 
 
464 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  31.49 
 
 
453 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  33.04 
 
 
447 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  33.04 
 
 
447 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  31.84 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  32.83 
 
 
452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  32.83 
 
 
452 aa  183  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  32.23 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  32.14 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.31 
 
 
460 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
469 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  29.44 
 
 
462 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  27.49 
 
 
446 aa  160  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
470 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  27 
 
 
438 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.87 
 
 
464 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  26.2 
 
 
464 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  28.5 
 
 
446 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  26 
 
 
464 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  26 
 
 
464 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  26 
 
 
464 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  26 
 
 
464 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
463 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  26 
 
 
464 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
475 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  25.76 
 
 
464 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26 
 
 
463 aa  150  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25.76 
 
 
464 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  26 
 
 
464 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.29 
 
 
445 aa  149  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  30.31 
 
 
438 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
463 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
467 aa  147  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
463 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  30.31 
 
 
438 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.13 
 
 
469 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  30.05 
 
 
408 aa  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  28.6 
 
 
429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
467 aa  140  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.92 
 
 
485 aa  140  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
412 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  28.04 
 
 
453 aa  137  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  27.01 
 
 
463 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  25.29 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  30.12 
 
 
475 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  25.76 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  26.73 
 
 
444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  25.76 
 
 
495 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  25.76 
 
 
546 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  25.76 
 
 
547 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  28.39 
 
 
455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  25.76 
 
 
547 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
486 aa  130  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  25.76 
 
 
546 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  27.7 
 
 
446 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  25.55 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.76 
 
 
495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  26.14 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.68 
 
 
518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.9 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  26.23 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
500 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  25 
 
 
429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  30.36 
 
 
453 aa  127  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.11 
 
 
472 aa  126  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
500 aa  126  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
464 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  27.16 
 
 
467 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.61 
 
 
499 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  28.3 
 
 
448 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
450 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  27.65 
 
 
453 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29 
 
 
462 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  26.49 
 
 
467 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
453 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
486 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.38 
 
 
467 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
445 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
466 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  27.04 
 
 
456 aa  123  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  26.91 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  28.02 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  24.53 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.89 
 
 
455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.68 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
481 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
500 aa  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  28.02 
 
 
451 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>