More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1461 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  76.54 
 
 		 500 aa  748    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  100 
 
 		 500 aa  961    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  39.38 
 
 		 485 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  38.82 
 
 		 486 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  35.57 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  36.27 
 
 		 538 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  36.05 
 
 		 454 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  36.03 
 
 		 485 aa  263  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  35.64 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  34.89 
 
 		 554 aa  259  9e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  33.4 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  33.64 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  34.54 
 
 		 481 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  33.2 
 
 		 490 aa  242  9e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  36.69 
 
 		 470 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 462 aa  237  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  32.92 
 
 		 498 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  33.96 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.74 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  29.32 
 
 		 455 aa  223  7e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  34.56 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  31.05 
 
 		 505 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  31.25 
 
 		 477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  30.75 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  29 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  31.71 
 
 		 475 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  29.26 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  33.7 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  28.45 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  28.63 
 
 		 461 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  30 
 
 		 464 aa  190  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 451 aa  189  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.25 
 
 		 453 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  29.7 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  31.3 
 
 		 482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  28.8 
 
 		 503 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.36 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 486 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.53 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.32 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.32 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.32 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.32 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.32 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.01 
 
 		 454 aa  170  6e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 475 aa  166  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  31.97 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 469 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 469 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  30.33 
 
 		 521 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 524 aa  161  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  26.9 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  29.08 
 
 		 463 aa  158  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 453 aa  157  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  30.32 
 
 		 503 aa  154  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 475 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.55 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  24.74 
 
 		 469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 463 aa  146  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.85 
 
 		 456 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  29.41 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  31.31 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 453 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  30.45 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  25.96 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 478 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  27.68 
 
 		 456 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 442 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>