More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1808 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  76.28 
 
 		 485 aa  725    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  100 
 
 		 499 aa  971    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  63.84 
 
 		 498 aa  610  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  67.09 
 
 		 486 aa  591  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  59.08 
 
 		 518 aa  586  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  59.12 
 
 		 500 aa  574  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  58.68 
 
 		 490 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  54.42 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  46.27 
 
 		 538 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  45.24 
 
 		 554 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  43.33 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  41.7 
 
 		 481 aa  329  7e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  37.71 
 
 		 525 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  38.7 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  34.42 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  35.55 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  35.55 
 
 		 500 aa  263  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  32.57 
 
 		 462 aa  256  6e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  35.64 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 451 aa  213  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  30.83 
 
 		 477 aa  206  8e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.82 
 
 		 460 aa  206  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  28.23 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  28.66 
 
 		 496 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  31.47 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  28.16 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 464 aa  180  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  27.98 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 445 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 453 aa  177  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  29.68 
 
 		 484 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 461 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.95 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  28.42 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  28.2 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.03 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 461 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  27.39 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  30.22 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 486 aa  156  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  28.45 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 455 aa  150  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 451 aa  150  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.67 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.67 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.67 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  30 
 
 		 454 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.57 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.47 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 453 aa  144  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  24.48 
 
 		 469 aa  144  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.47 
 
 		 469 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  28.4 
 
 		 457 aa  143  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 459 aa  143  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.26 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  27.07 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  24.2 
 
 		 468 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.34 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 454 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 455 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.78 
 
 		 452 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  22.45 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.65 
 
 		 482 aa  136  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>