More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0762 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  100 
 
 
458 aa  909    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  38.88 
 
 
464 aa  316  5e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  38.88 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  35.87 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  34.67 
 
 
469 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  34.44 
 
 
452 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  33.19 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  34.25 
 
 
446 aa  247  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  34.58 
 
 
438 aa  240  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  32.66 
 
 
450 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  33.09 
 
 
469 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  34.77 
 
 
468 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  33.76 
 
 
483 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  32.13 
 
 
459 aa  227  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  34.8 
 
 
408 aa  224  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  36.14 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  35.31 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.76 
 
 
460 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  32.03 
 
 
453 aa  210  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  35.37 
 
 
462 aa  210  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.41 
 
 
464 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  34.19 
 
 
453 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  30.36 
 
 
475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  33.57 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  33.26 
 
 
452 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  32.41 
 
 
452 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  28.41 
 
 
470 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  29.22 
 
 
442 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  29.06 
 
 
459 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.87 
 
 
468 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  32.69 
 
 
451 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
461 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  29.22 
 
 
484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  29.11 
 
 
456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  29.22 
 
 
546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  29.22 
 
 
546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  29 
 
 
495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  29 
 
 
484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  29 
 
 
547 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  29 
 
 
547 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.97 
 
 
445 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  28.3 
 
 
495 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  29.13 
 
 
467 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  30.44 
 
 
444 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  30.28 
 
 
472 aa  171  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  29.98 
 
 
448 aa  170  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  28.08 
 
 
450 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  29.03 
 
 
474 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  29.03 
 
 
474 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  29.18 
 
 
476 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  29.36 
 
 
500 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  27.74 
 
 
480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
464 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
463 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.33 
 
 
500 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  29.21 
 
 
484 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
464 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  25.84 
 
 
464 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  25.84 
 
 
464 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
464 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
464 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  29.44 
 
 
474 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  28.03 
 
 
475 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.77 
 
 
463 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  27.93 
 
 
476 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
464 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
464 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.45 
 
 
454 aa  156  7e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  26.93 
 
 
502 aa  156  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  29.45 
 
 
470 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  30.04 
 
 
468 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  30.04 
 
 
468 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  30.04 
 
 
468 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  30.04 
 
 
468 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  30.04 
 
 
468 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  30.04 
 
 
468 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
485 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
499 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
464 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  30.04 
 
 
468 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
475 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  27.43 
 
 
478 aa  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  30.27 
 
 
464 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.12 
 
 
538 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  30.14 
 
 
462 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
448 aa  150  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
486 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.62 
 
 
518 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  27.78 
 
 
445 aa  150  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
525 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
456 aa  150  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
463 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  26.91 
 
 
429 aa  150  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  30.14 
 
 
462 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  28.47 
 
 
442 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  29.47 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  27.29 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  29.86 
 
 
470 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  29.71 
 
 
462 aa  148  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>