More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3692 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  100 
 
 		 461 aa  913    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  36.42 
 
 		 475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  33.19 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  32 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  32 
 
 		 464 aa  239  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  30.97 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  34.59 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  30.15 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  36.24 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  35.98 
 
 		 452 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  29.28 
 
 		 459 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  31.93 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 453 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  30.22 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  30.94 
 
 		 447 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  32.18 
 
 		 408 aa  189  8e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 470 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 461 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  30.48 
 
 		 483 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  27.42 
 
 		 484 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  27.35 
 
 		 495 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  27.19 
 
 		 547 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  27.19 
 
 		 546 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  27.19 
 
 		 547 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.97 
 
 		 546 aa  170  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.97 
 
 		 484 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  29.57 
 
 		 472 aa  167  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  32.29 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0048  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.331446 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  26.64 
 
 		 474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  26.52 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  26.36 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 462 aa  149  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.67 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  26.8 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 518 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  25.89 
 
 		 502 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  26.37 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  26.14 
 
 		 476 aa  144  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 490 aa  143  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  26.14 
 
 		 474 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 464 aa  143  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.81 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  29.16 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.24 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  25.93 
 
 		 474 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 469 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  28.05 
 
 		 471 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.05 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.05 
 
 		 469 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.05 
 
 		 469 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.05 
 
 		 469 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.05 
 
 		 469 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 499 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  22.15 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  30.95 
 
 		 474 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 469 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  25.22 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  24.55 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  25.76 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>