More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2358 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  100 
 
 
467 aa  929    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  30.42 
 
 
500 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  32.18 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30.31 
 
 
500 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  30.3 
 
 
485 aa  208  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  29.02 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  31.67 
 
 
460 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
453 aa  193  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  29.54 
 
 
498 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.27 
 
 
470 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.51 
 
 
499 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.89 
 
 
445 aa  183  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.37 
 
 
525 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  29.27 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.96 
 
 
463 aa  180  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28.09 
 
 
538 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
518 aa  176  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  28.87 
 
 
475 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.27 
 
 
468 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
554 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  27.16 
 
 
461 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
464 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.36 
 
 
481 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.51 
 
 
464 aa  164  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.51 
 
 
464 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
500 aa  163  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
485 aa  162  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  24.29 
 
 
467 aa  161  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  25.68 
 
 
485 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  29.28 
 
 
498 aa  160  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.29 
 
 
462 aa  160  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  31.07 
 
 
454 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  25.65 
 
 
469 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
467 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  29.41 
 
 
470 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.43 
 
 
469 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.43 
 
 
469 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.43 
 
 
469 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  25.43 
 
 
469 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  25.6 
 
 
469 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  25.65 
 
 
469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
469 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  28.35 
 
 
463 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
438 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  24.37 
 
 
463 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  28.82 
 
 
486 aa  154  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
475 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
477 aa  153  7e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.35 
 
 
475 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  24.6 
 
 
496 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
461 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
458 aa  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
459 aa  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  27.54 
 
 
469 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
450 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  27.4 
 
 
463 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.87 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.18 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.54 
 
 
475 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  24.26 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.48 
 
 
469 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  25.79 
 
 
441 aa  143  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.79 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  26.75 
 
 
521 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
460 aa  141  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.32 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
459 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  24.52 
 
 
480 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  23.2 
 
 
448 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  25.53 
 
 
471 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  30.23 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  31.62 
 
 
455 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  23.61 
 
 
469 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  23.61 
 
 
469 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  31.62 
 
 
455 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  31.62 
 
 
455 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
469 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  31.34 
 
 
455 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  24.14 
 
 
450 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  25.5 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.52 
 
 
505 aa  136  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  29.83 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  27.9 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.37 
 
 
454 aa  134  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.58 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  24.5 
 
 
450 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  30.31 
 
 
452 aa  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  25.36 
 
 
450 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.92 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.36 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.43 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  32.22 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  22.88 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.23 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2343  MATE efflux family protein  27.65 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>