More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1839 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  100 
 
 		 480 aa  954    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  72.86 
 
 		 469 aa  698    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  71.79 
 
 		 469 aa  679    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  73.08 
 
 		 469 aa  697    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  73.08 
 
 		 469 aa  697    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  70.94 
 
 		 469 aa  656    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  73.08 
 
 		 469 aa  697    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  73.08 
 
 		 469 aa  694    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  71.79 
 
 		 469 aa  679    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  73.29 
 
 		 469 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  79.58 
 
 		 478 aa  737    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  73.08 
 
 		 469 aa  697    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  73.29 
 
 		 469 aa  694    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  73.72 
 
 		 469 aa  701    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  71.37 
 
 		 469 aa  661    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  60.39 
 
 		 476 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  47.77 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  45.36 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  45.7 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  45.7 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  45.02 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  46.44 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  41.65 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  45.56 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  74.37 
 
 		 270 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  40.31 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  41.29 
 
 		 458 aa  348  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  71.12 
 
 		 238 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  36.97 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  34.26 
 
 		 521 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  37.22 
 
 		 486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  35.19 
 
 		 492 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  34.35 
 
 		 503 aa  263  6e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  33.33 
 
 		 482 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  33.69 
 
 		 524 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  34.33 
 
 		 503 aa  253  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  33.92 
 
 		 494 aa  246  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.28 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  29.42 
 
 		 465 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.88 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 538 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  32.56 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.51 
 
 		 485 aa  177  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 462 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 453 aa  171  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  28.14 
 
 		 554 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  25.21 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  30.15 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 449 aa  160  6e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.84 
 
 		 500 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.54 
 
 		 462 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 461 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  23.46 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 448 aa  147  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 467 aa  146  9e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  25.72 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  28.44 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  26.06 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 469 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.36 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 458 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 477 aa  140  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.82 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.87 
 
 		 458 aa  136  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  28.15 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  28.35 
 
 		 446 aa  134  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  23.25 
 
 		 453 aa  130  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 483 aa  129  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  22.77 
 
 		 453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>