More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30280 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  100 
 
 		 477 aa  933    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  53.3 
 
 		 522 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  56.21 
 
 		 494 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  53.39 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  41.52 
 
 		 458 aa  350  2e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  40.32 
 
 		 446 aa  327  4.0000000000000003e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  42.34 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  43.98 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  34.07 
 
 		 453 aa  260  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  31.51 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  36.26 
 
 		 451 aa  246  9e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  31.09 
 
 		 446 aa  229  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  31.98 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  30.7 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 457 aa  204  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 448 aa  189  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  30 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  30.39 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 486 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  28.92 
 
 		 492 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  31.06 
 
 		 521 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  27.4 
 
 		 496 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  27.15 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  28.15 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  28.15 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  28.15 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29 
 
 		 469 aa  136  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  27.98 
 
 		 469 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.92 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 480 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 460 aa  134  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  28.89 
 
 		 468 aa  133  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.85 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  30.48 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  30.48 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  27.02 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  31.28 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  31.8 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  30.26 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  31.72 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26 
 
 		 458 aa  117  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  26.24 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  26.78 
 
 		 494 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 524 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 476 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 503 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  30.39 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.39 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.75 
 
 		 468 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  28.85 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  26.37 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 462 aa  103  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  29.66 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0534  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.48 
 
 		 462 aa  100  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  25 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  30.42 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.34 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  22.88 
 
 		 462 aa  98.2  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25 
 
 		 490 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 438 aa  97.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 437 aa  97.1  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.38 
 
 		 485 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 437 aa  95.9  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  28.85 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  26.14 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 455 aa  94  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 464 aa  93.2  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 464 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  29.22 
 
 		 455 aa  93.6  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  26.89 
 
 		 475 aa  93.2  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>