More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03157 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  85.05 
 
 		 455 aa  734    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  878    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  85.05 
 
 		 455 aa  734    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  63.7 
 
 		 471 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  60 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  57.24 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  52.97 
 
 		 491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  54 
 
 		 472 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  55.68 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  42.63 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  42.21 
 
 		 469 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  41.76 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  41.76 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  41.76 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  41.76 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  41.76 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  41.76 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  41.76 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  42.34 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  42.34 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  43.31 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  45.02 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  46.85 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  41.86 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  41.63 
 
 		 469 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  42.4 
 
 		 458 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  38.55 
 
 		 521 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  36.94 
 
 		 486 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  36.55 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  36.02 
 
 		 492 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  37.88 
 
 		 503 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  37.53 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  36.7 
 
 		 524 aa  237  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  37.76 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  33.79 
 
 		 494 aa  222  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  43.78 
 
 		 270 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.58 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 460 aa  192  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  35.41 
 
 		 481 aa  183  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  32.15 
 
 		 486 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  38.97 
 
 		 238 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  31.29 
 
 		 465 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  30.43 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 518 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 490 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  29.34 
 
 		 499 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 454 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  31.3 
 
 		 442 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 500 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.88 
 
 		 525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.33 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  26.12 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 445 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 446 aa  132  9e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 522 aa  132  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  29.72 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 458 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.91 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 538 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  30.26 
 
 		 477 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 464 aa  126  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  24.54 
 
 		 464 aa  126  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.47 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 469 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  24.94 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  27.78 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 455 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.54 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  27.77 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 452 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>