More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2736 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  100 
 
 
452 aa  860    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
453 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  34.34 
 
 
486 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  28.21 
 
 
443 aa  151  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
448 aa  149  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.14 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  34.75 
 
 
503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.45 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  27.65 
 
 
445 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.79 
 
 
457 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
469 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  27.03 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  28 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  30.54 
 
 
496 aa  134  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  26.37 
 
 
469 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  26.59 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
460 aa  131  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  26.37 
 
 
469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.98 
 
 
468 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  29.87 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  25.54 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  25.54 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  25.54 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  28.85 
 
 
477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  27.48 
 
 
442 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  30.45 
 
 
451 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  27.69 
 
 
446 aa  127  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  29.35 
 
 
458 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  31.53 
 
 
492 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.78 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.71 
 
 
480 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  28.16 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  29.21 
 
 
522 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  29.28 
 
 
476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
469 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  26.76 
 
 
469 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  30.96 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  29.41 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  33.33 
 
 
521 aa  118  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  24.76 
 
 
448 aa  117  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  32.44 
 
 
455 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  21.53 
 
 
453 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  24.73 
 
 
469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
448 aa  116  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  28.49 
 
 
455 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30.77 
 
 
500 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  28.49 
 
 
455 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.56 
 
 
460 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  24.95 
 
 
469 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  29.36 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.14 
 
 
490 aa  111  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
525 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.71 
 
 
454 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.22 
 
 
455 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.77 
 
 
486 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
477 aa  107  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  29.38 
 
 
471 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
498 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  32.55 
 
 
408 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  25.73 
 
 
505 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  29.2 
 
 
491 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  29.82 
 
 
465 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  31.23 
 
 
500 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  27.22 
 
 
442 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  29.08 
 
 
449 aa  101  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26.26 
 
 
458 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.66 
 
 
554 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.34 
 
 
450 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  29.91 
 
 
458 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.37 
 
 
500 aa  100  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.26 
 
 
485 aa  99.8  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  28.57 
 
 
468 aa  99  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27.51 
 
 
481 aa  98.2  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.13 
 
 
518 aa  97.1  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  24.45 
 
 
453 aa  97.1  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.35 
 
 
438 aa  96.7  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
462 aa  96.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  24.92 
 
 
524 aa  96.7  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
461 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.64 
 
 
463 aa  96.3  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.72 
 
 
538 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
499 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.37 
 
 
464 aa  94.4  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
464 aa  94  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  27.87 
 
 
481 aa  94  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  25.67 
 
 
472 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  25.71 
 
 
469 aa  93.2  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  21.3 
 
 
475 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
458 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.25 
 
 
475 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.15 
 
 
483 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.44 
 
 
463 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
467 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
470 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  31.21 
 
 
454 aa  90.5  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.78 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>