More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0162 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  100 
 
 		 449 aa  875    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  85.97 
 
 		 449 aa  707    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  65.22 
 
 		 436 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  61.35 
 
 		 471 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  57.91 
 
 		 455 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  57.91 
 
 		 455 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  57.24 
 
 		 455 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  53.81 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  52.7 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  47.02 
 
 		 469 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  47.23 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  47.11 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  46.78 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  46.78 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  46.78 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  46.78 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  46.78 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  46.78 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  45.64 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  45.64 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  46.88 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  46.09 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  45.78 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  46.44 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  47.2 
 
 		 476 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  41.82 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  32.51 
 
 		 496 aa  242  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 486 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  34.17 
 
 		 503 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  32.44 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  48.94 
 
 		 270 aa  226  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  35.48 
 
 		 503 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  33.77 
 
 		 521 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  30.73 
 
 		 482 aa  216  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  33.85 
 
 		 494 aa  216  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 448 aa  203  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  34.04 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  44.86 
 
 		 238 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  34.52 
 
 		 481 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  30.57 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 462 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 500 aa  149  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.3 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.63 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 448 aa  147  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  32.08 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 499 aa  140  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 457 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.01 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  25.7 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 498 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 522 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.37 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 469 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  25.59 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 467 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.29 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.08 
 
 		 461 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.19 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 525 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.01 
 
 		 462 aa  120  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.26 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 453 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  27.87 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  27.67 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  23.52 
 
 		 456 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.38 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  27.4 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.4 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  27.12 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>