More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2889 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  100 
 
 		 471 aa  909    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  62.58 
 
 		 472 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  63.7 
 
 		 455 aa  534  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  62.31 
 
 		 455 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  62.31 
 
 		 455 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  58.44 
 
 		 491 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  62.92 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  61.35 
 
 		 449 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  61.24 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  46.31 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  44.19 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  44.19 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  44.19 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  44.3 
 
 		 469 aa  405  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  45.86 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  44.19 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  45.86 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  45.11 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  43.25 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  47.58 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  44.32 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  45.09 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  44.32 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  44.64 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  45.36 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  43.1 
 
 		 458 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  38.27 
 
 		 496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  36.67 
 
 		 492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  38.07 
 
 		 486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  37.61 
 
 		 503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  35.57 
 
 		 482 aa  242  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  35.78 
 
 		 524 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  34.77 
 
 		 521 aa  240  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  35.76 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  34.7 
 
 		 494 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  49.79 
 
 		 270 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  31.84 
 
 		 465 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.51 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  35.28 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  32.56 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  40.57 
 
 		 238 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.46 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 498 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 448 aa  160  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  30.54 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 453 aa  154  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  29.25 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 518 aa  150  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 500 aa  143  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 468 aa  143  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 499 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  26.77 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  30.86 
 
 		 468 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.82 
 
 		 500 aa  130  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.81 
 
 		 525 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  28.5 
 
 		 477 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.02 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 469 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 554 aa  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.42 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  27.48 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  30.46 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  23.18 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  22.61 
 
 		 470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.52 
 
 		 481 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  24.61 
 
 		 475 aa  114  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  26.94 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  25.05 
 
 		 469 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 453 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>