More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3173 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  100 
 
 		 448 aa  894    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  52.4 
 
 		 443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  44.52 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  36.32 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  38.74 
 
 		 448 aa  266  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  35.24 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  32.11 
 
 		 468 aa  239  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  34.93 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  34.86 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  36.18 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  37.37 
 
 		 458 aa  229  6e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  33.11 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  32.65 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  34.51 
 
 		 453 aa  202  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  32.04 
 
 		 522 aa  199  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  31.17 
 
 		 460 aa  196  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  35.67 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 453 aa  190  5e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  30.4 
 
 		 469 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.89 
 
 		 469 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.74 
 
 		 469 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 454 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  29.52 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  29.52 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  29.52 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29.52 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  29.07 
 
 		 469 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  28.25 
 
 		 442 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  27.25 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  31.49 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  30.21 
 
 		 494 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  26.67 
 
 		 492 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  30.49 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  30.49 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 486 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  29.05 
 
 		 469 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  30.39 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  28.19 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.71 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  29.85 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  31.99 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  26.71 
 
 		 471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  26.04 
 
 		 455 aa  153  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 524 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  28.77 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 455 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  26.87 
 
 		 455 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 470 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 472 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  28 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  30.04 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 499 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  28.29 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  28.17 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  25.65 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.51 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  26.59 
 
 		 491 aa  143  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.35 
 
 		 437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  30.77 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.67 
 
 		 485 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.84 
 
 		 500 aa  140  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  28.61 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 476 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  27.33 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  30.45 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  30.45 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.71 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 456 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1086  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 616 aa  131  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000719334  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  27.13 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 453 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.49 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  27.15 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>