More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1159 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  100 
 
 
478 aa  951    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  72.86 
 
 
469 aa  679    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  72.44 
 
 
469 aa  682    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  73.54 
 
 
469 aa  677    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  72.65 
 
 
469 aa  683    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  72.65 
 
 
469 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  72.65 
 
 
469 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  72.57 
 
 
469 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  73.54 
 
 
469 aa  677    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  73.5 
 
 
469 aa  687    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  73.54 
 
 
469 aa  657    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  72.65 
 
 
469 aa  680    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  72.65 
 
 
469 aa  682    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  74.13 
 
 
469 aa  680    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  79.58 
 
 
480 aa  723    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  57.68 
 
 
476 aa  522  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  47.65 
 
 
449 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  45.11 
 
 
471 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  44.44 
 
 
455 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  44.44 
 
 
455 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  43.31 
 
 
455 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  46.88 
 
 
449 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  42.19 
 
 
491 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  46.24 
 
 
436 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  73.42 
 
 
270 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  40.04 
 
 
472 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  38.86 
 
 
458 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  71.55 
 
 
238 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  36.64 
 
 
492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  36.2 
 
 
496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  34.79 
 
 
503 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  34.44 
 
 
486 aa  266  7e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  32.14 
 
 
521 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  35.48 
 
 
503 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  35.23 
 
 
524 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  32.68 
 
 
482 aa  259  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  33.48 
 
 
494 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  32.43 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  30.4 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  32.21 
 
 
448 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.19 
 
 
486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
462 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.47 
 
 
460 aa  179  7e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  31.35 
 
 
481 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.84 
 
 
538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.91 
 
 
468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  28.32 
 
 
485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.55 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  30.31 
 
 
446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  29.13 
 
 
453 aa  162  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  28.69 
 
 
554 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  28.4 
 
 
449 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  29.71 
 
 
453 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  28.86 
 
 
443 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
485 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.85 
 
 
490 aa  157  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.06 
 
 
500 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.79 
 
 
481 aa  156  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.37 
 
 
500 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  27.61 
 
 
500 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  29.95 
 
 
453 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.31 
 
 
454 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  28.3 
 
 
525 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  26.53 
 
 
442 aa  154  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.84 
 
 
445 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
477 aa  150  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
498 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  23.29 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.76 
 
 
448 aa  149  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.21 
 
 
499 aa  146  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  26.39 
 
 
446 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  23.66 
 
 
460 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.31 
 
 
461 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  23.54 
 
 
469 aa  143  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.45 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  29.25 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.28 
 
 
458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  29.35 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.23 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  23.91 
 
 
518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  25.55 
 
 
445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.3 
 
 
463 aa  140  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
467 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.87 
 
 
458 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  24.68 
 
 
469 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  24.73 
 
 
455 aa  136  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
470 aa  136  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.94 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  28.5 
 
 
458 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  28.23 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  30.11 
 
 
454 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.62 
 
 
467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.7 
 
 
460 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.1 
 
 
453 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
458 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  20.93 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  22.04 
 
 
475 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.72 
 
 
463 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>