More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0217 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  100 
 
 		 445 aa  871    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  37.69 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  31.51 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  34.28 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  36.04 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  35.78 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  32.06 
 
 		 458 aa  251  1e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  34.45 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 494 aa  233  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  35.59 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  33.41 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  33.42 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  28.9 
 
 		 500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  30.89 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  32.21 
 
 		 442 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  30.53 
 
 		 408 aa  206  7e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  31.52 
 
 		 449 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  29.97 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  29.07 
 
 		 469 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  28.48 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  28.48 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  28.48 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  28.48 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  28.25 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  28.25 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  28.25 
 
 		 469 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.48 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 469 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29.19 
 
 		 462 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 478 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  27.55 
 
 		 455 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 486 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  25.66 
 
 		 491 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  32.92 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 472 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  27.81 
 
 		 468 aa  139  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2736  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  25.06 
 
 		 496 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  25.17 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 524 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.32 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  27.96 
 
 		 455 aa  126  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  25.64 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.57 
 
 		 445 aa  123  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  25.82 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  26.37 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.46 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.79 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 468 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  23.59 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 525 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.08 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.28 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  24.65 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  26.39 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 447 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1922  MATE efflux family protein  23 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 477 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  22.79 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  27.04 
 
 		 462 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  34.76 
 
 		 238 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 455 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 521 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  21.68 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>