More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1509 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  94.57 
 
 		 460 aa  845    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  88.26 
 
 		 460 aa  801    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  80.26 
 
 		 457 aa  716    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  100 
 
 		 460 aa  902    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  46.12 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  49 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  44.25 
 
 		 485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  45.68 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  45.23 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  42.25 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  42.38 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  39.37 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  40.76 
 
 		 467 aa  344  2e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  42.04 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  39.32 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  32.3 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  31.97 
 
 		 462 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.5 
 
 		 455 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  29.04 
 
 		 455 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  28.82 
 
 		 455 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  28.81 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  32.47 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.74 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.84 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.44 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.09 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.29 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  28.45 
 
 		 451 aa  159  9e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.9 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  26.21 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.74 
 
 		 455 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 470 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  29.2 
 
 		 440 aa  146  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  24.94 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 460 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27 
 
 		 457 aa  143  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.93 
 
 		 462 aa  143  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  29.26 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  28.13 
 
 		 447 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  37.19 
 
 		 210 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  28.05 
 
 		 496 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.18 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  27.06 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 461 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.03 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  28.47 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  25.84 
 
 		 460 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.58 
 
 		 466 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.07 
 
 		 493 aa  133  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 486 aa  133  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  25.35 
 
 		 454 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.11 
 
 		 499 aa  132  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  24.88 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  24.12 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5728  hypothetical protein  27.18 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  29.77 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.8 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  25.22 
 
 		 451 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 460 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  25 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  25 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  27.21 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  25 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  28.24 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.85 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  24.39 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  24.27 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  25.94 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 525 aa  128  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  24.4 
 
 		 538 aa  127  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  26 
 
 		 503 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 452 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>