More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1575 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  901    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  59.91 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  39.86 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  37.69 
 
 		 485 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  37.97 
 
 		 450 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  38.41 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  38.41 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  32.59 
 
 		 462 aa  219  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  26.46 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  27.1 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  27.07 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.64 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 477 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 455 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  24.37 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  32.34 
 
 		 457 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  27.06 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  30.32 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  25.84 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  26.98 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.27 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 455 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  26.46 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  24.14 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  24.15 
 
 		 466 aa  120  6e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  23.54 
 
 		 466 aa  120  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  26.29 
 
 		 449 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  26.54 
 
 		 448 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  24.66 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 460 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  25.69 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.35 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.55 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.74 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  20.96 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  25.93 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  23.68 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  24.24 
 
 		 458 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  23.87 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  22.78 
 
 		 453 aa  104  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  27.22 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  26.24 
 
 		 478 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  22.78 
 
 		 496 aa  98.2  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  26.29 
 
 		 452 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 437 aa  97.1  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 489 aa  96.7  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.06 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  23.4 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 447 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  25.18 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  23.94 
 
 		 451 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  24.53 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  21.11 
 
 		 456 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 462 aa  94  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  23.63 
 
 		 451 aa  93.6  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  24.07 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  24.3 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  24.07 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  23.47 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 451 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  23.71 
 
 		 452 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  23.82 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3963  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0920263  normal  0.56178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  22.07 
 
 		 453 aa  88.2  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  22.98 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 502 aa  87  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  21.92 
 
 		 467 aa  87  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  23.66 
 
 		 448 aa  87  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 456 aa  87  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0460  MATE efflux family protein  23.99 
 
 		 451 aa  86.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  23.71 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  22.59 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>