More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2636 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  100 
 
 		 478 aa  950    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  57.36 
 
 		 485 aa  514  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  46.56 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  46.12 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  46.55 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  47.15 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  42.67 
 
 		 454 aa  395  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  42.73 
 
 		 473 aa  395  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  44.35 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1858  MATE efflux family protein  39.78 
 
 		 467 aa  361  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0434953  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  42.13 
 
 		 455 aa  356  5e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  41.24 
 
 		 437 aa  342  8e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  41.01 
 
 		 437 aa  340  4e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  41.69 
 
 		 458 aa  335  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  37.95 
 
 		 454 aa  325  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 460 aa  206  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3661  integral membrane protein  49.24 
 
 		 210 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00609977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  30.3 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  29.93 
 
 		 455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  31.57 
 
 		 452 aa  160  6e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  31.63 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  32.09 
 
 		 462 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.34 
 
 		 458 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  27.99 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  31.25 
 
 		 467 aa  146  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.31 
 
 		 453 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  26.91 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 461 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26.2 
 
 		 467 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0849  multi antimicrobial extrusion protein MatE  37.1 
 
 		 190 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.471879  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.31 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.37 
 
 		 447 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  26.96 
 
 		 463 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  28.5 
 
 		 451 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 451 aa  136  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.6 
 
 		 456 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  25.64 
 
 		 538 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  26.09 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 460 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.71 
 
 		 455 aa  133  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  27.19 
 
 		 472 aa  132  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 445 aa  133  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  24.51 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 454 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.54 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0835  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0828  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.81 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  23.64 
 
 		 554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.01 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  25.92 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.43 
 
 		 498 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 477 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  24.66 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  25.89 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  26.63 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  28.1 
 
 		 460 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.82 
 
 		 455 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  25.74 
 
 		 447 aa  123  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 466 aa  123  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  24.64 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  27.92 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  28.25 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 453 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.69 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  26.92 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.35 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 448 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  27.67 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  25.88 
 
 		 505 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 470 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 462 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.16 
 
 		 496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>