More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02728 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  100 
 
 		 460 aa  908    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  61.69 
 
 		 453 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  56.16 
 
 		 462 aa  518  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  41.98 
 
 		 456 aa  333  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  40.62 
 
 		 454 aa  332  6e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  40.97 
 
 		 451 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  39.64 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  39.64 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  39.64 
 
 		 455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  39.41 
 
 		 455 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  41.67 
 
 		 455 aa  325  7e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  36.97 
 
 		 452 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  39.95 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  40.04 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  39.56 
 
 		 455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  40.05 
 
 		 459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  37.44 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  37.21 
 
 		 452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  41.31 
 
 		 460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  42.57 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  37.13 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  37.67 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  36.7 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  35.27 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  33.94 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  33.87 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  33.95 
 
 		 467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  32.59 
 
 		 478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  33.87 
 
 		 444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  32.43 
 
 		 445 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  32.94 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1317  MATE efflux family protein  34.11 
 
 		 443 aa  189  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.327813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  30.87 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.41 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.92 
 
 		 458 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  30.66 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  29.83 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.53 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.7 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  27.94 
 
 		 509 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 505 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 495 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 501 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 515 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.88 
 
 		 518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 515 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  28.12 
 
 		 531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 521 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 462 aa  136  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 503 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.62 
 
 		 468 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.53 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  27.82 
 
 		 516 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.97 
 
 		 525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 439 aa  133  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 481 aa  133  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  27.75 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.22 
 
 		 498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 459 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 465 aa  130  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  25.22 
 
 		 448 aa  129  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 500 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  27.36 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 443 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.69 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  24.49 
 
 		 459 aa  127  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.02 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.83 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  25.78 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.73 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5118  multi anti extrusion protein MatE  27.88 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1790  hypothetical protein  26.77 
 
 		 443 aa  123  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.8 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  24.13 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.11 
 
 		 463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>